Zde naleznete seznam některých programů pro použití v Chemii, které jsou dostupné v Ubuntu.
Periodické tabulky
Kalzium
Kalzium je součástí projektu KDE-Edu. Jedná se o propracovanou periodickou tabulku umožňující zobrazit různé zajímavé informace o jednotlivých prvcích jako například model atomu, izotopy, vyzařovaná spektra a různé další informace. Obsahuje také jednoduchý editor molekul, nástroj pro vyčíslování chemických rovnic a další zajímavé nástroje.
Instalace
Nainstalujte balík kalzium.
Spuštění
Kalzium můžete spustit z nabídky Aplikace → Věda → Kalzium, případně příkazem kalzium.
gPeriodic
gPeriodic je oproti předchozí aplikaci mnohem jednodušší - neobsahuje žádné rozšiřující nástroje, ale pro potřeby periodické tabulky je zcela dostačující. Po kliknutí na jednotlivé prvky se zobrazí podrobnější informace včetně takových detailů jako například ionizační energie, elektronová konfigurace nebo objevitel daného prvku.
Instalace
Nainstalujte balík gperiodic.
Spuštění
Aplikaci můžete spustit z nabídky Aplikace → Věda → GPeriodic, případně příkazem gperiodic.
Strukturní vzorce
BKChem
BKchem je v Pythonu napsaný editor vzorců organických sloučenin. Kromě prostého kreslení sloučenin můžete vytvářet i reakce. Vytvořená data můžete ukládat do mnoha formátů včetně SVG nebo PDF.
Instalace
Nainstalujte balík bkchem.
Spuštění
Aplikaci můžete spustit z nabídky Aplikace → Věda → BKchem, případně příkazem bkchem.
Chemtool
Chemtool představuje další z nástrojů pro snadné kreslení strukturních vzorců organických sloučenin. Kromě nástrojů pro kreslení sloučenin a vytváření reakcí nabízí také malou databázi předpřipravených orgranických látek.
Instalace
Nainstalujte balík chemtool.
Spuštění
Aplikaci můžete spustit z nabídky Aplikace → Věda → Chemtool, případně příkazem chemtool.
JChemPaint
JChemPaint je v Javě napsaný prohlížeč a editor strukturních vzorců chemických látek, nabízející jednoduché a uživatelsky přívětivé prostředí.
Pro více informací navštivte stránku JChemPaint.
3D modelování molekul
PyMOL
PyMOL je propracovaný nástroj pro tvorbu trojrozměrných modelů molekul a to včetně tak složitých struktur jako jsou proteiny. Podle autorů programu je víc jak čtvrtina všech obrázků proteinů ve vědecké literatuře je vytvořena právě pomocí PyMOL.
Instalace
Nainstalujte balík pymol.
Spuštění
Aplikaci můžete spustit z nabídky Aplikace → Věda → PyMOL Molecular Graphics System, případně příkazem pymol.
Avogadro
Avogadro je pokorčilý multiplatformní 3D editor chemických struktur určený pro použití v počítačové chemii, modelování molekul, bioinformatice, nauce o materiálech a dalších příbuzných oborech. Avogadro je velmi komplexním nástrojem, který lze navíc rozšiřovat a upravovat pomocí dalších zásuvných modelů a skriptů.
Instalace
Nainstalujte balík avogadro.
Spuštění
Aplikaci můžete spustit z nabídky Aplikace → Věda → Avogadro, případně příkazem avogadro.
Ostatní
MestReNova
MestReNova je multiplatformní profesionální software pro zpracování a analýzu dat z NMR spektroskopie. Nejlevnější licence se pohybuje kolem dvou set dolarů, k dispozici je trial verze fungující 45 dní.
Instalace
Z domovské stránky programu si stáhněte DEB balík pro vaše vydání Ubuntu a poklikáním ho nainstalujte
Spuštění
Aplikaci můžete spustit z nabídky Aplikace → Příslušenství → MestReNova.
Odkazy
Ubuntu Science - seznam aplikací pro vědu a vzdělání pro Ubuntu
Autor návodu: VojtěchTrefný